Muitas vezes em um gráfico a abscissa e/ou a ordenada apresentam valores com casas decimais. O R por padrão utiliza ponto decimal e não vírgula. Para colocar a vírgula decimal podemos sobrescrever ou escrever os valores dos eixos com as funções axis, pretty, chartr, as.character e format. O eixo (axis) 1 é o inferior, o 2 da direita, o 3 o superior e o 4 da esquerda. O número de casas decimais é indicada em nsmall.
Se colocarmos na função plot a indicação axes=F nenhum dos eixos é desenhado. Abaixo estão exemplos de como colocar vírgulas decimais.
x<-c(1,2,3,4,5)
y<-c(0.1,0.3,0.5,0.7,0.9)
plot(x,y)
axis(2,at=pretty(y),labels=chartr(".", ",", as.character(format(pretty(y),nsmall=1))))
plot(x/100,y,axes=F)
axis(1,at=pretty(x/100),labels=chartr(".", ",", as.character(format(pretty(x/100),nsmall=2))))
axis(2,at=pretty(y),labels=chartr(".", ",", as.character(format(pretty(y),nsmall=1))))
box()